導電膠點膠加工機編程方法有兩種：一種是手持控制手柄編程控制膠路徑；一種是使用工業控制機編程控制膠路徑；工業控制機和手持控制手柄可導入CAD圖形文件。

點膠機還采用三維工作方式進行導電點膠加工，而不是人工點膠方式。人工點膠效率跟不上自動化工作速度，人工點膠逐漸被取代。點膠機操作人員在使用時會發現，導電點膠加工的效果總是與理想的不同。一般來說，導電點膠加工需要鐵氟龍針作為出口，以防止膠水堵塞針頭，這與三維點膠的工作原理有關。點膠機運行時會產生一定的誤差值，因此在使用手持控制手柄編程時需要考慮這些參數。

另一種是通過工業控制機編程控制膠路徑，可以提前編制導電膠加工程序，使機器按程序，可以同時操作修改，誤差較小，但編程時間長，需要多次調整修改。

另一種是使用 CAD工程軟件可以根據導電膠點膠加工繪制點膠路徑圖。現在可以導入工控機和手持控制手柄。CAD圖形文件，這種事情更方便，可以節省很多時間。然而，繪制CAD圖形文件需要注意很多細節，否則點膠機在導電點膠過程中會出現誤差。